Na Med Med | Ho atamelana le batho ba maemo a mangata ho botsa tumar e kopaneng

Na Med Med | Ho khutlela ho 'mampoli e mengata ea hlasimo e kopaneng, ho itšireletsa kankere ea likokoana-hloko ea mofets'e e nang le mofets'e o senolang tšebelisano ea microbiome ka sesole sa mmele
Leha borikhoe ba boholo ba Colon ho tseba likeletso tsa kalafo. Bafuputsi ba hlokometse ho haella ha botsoalle pakeng tsa likarabo tsa likokoana-hloko, le tumor stromal colorm ea mofets'e ebile e pholoha.

Joalokaha lipatlisiso li hatetse pele, tse fumanehang ka mofets'e .
Ho hlakola kamano lipakeng tsa ho rarahana ha PhenotyPepity le sephetho cents (icr). Sehlopha se ile sa etsa tlhahlobo e phethahetseng ea bakuli ba Frenzen ho tloha ho bakuli ba Colozen e nang le mofets'e oa li-colours le tse phetseng hantle tsa li-conkili tsa li-colorlia. genemenome e lekanyetsoang ho hlakisa microbiome. Ho ile ha phatlalatsoa thuto e le moriana oa tlholeho e le "tumar e kopaneng, ackiome atlas ea coloon kankere ea bong".

Sengoloa se phatlalalitsoeng ka har'a meriana ea tlholeho

Kakaretso ea AC-ICAM

Bafuputsi ba sebelisitse sethala sa meno sa orthogonal ho sekaseka sampole tse ncha tsa tumor le li-tris tse ntle tsa kolone (tumor-e tloaelehileng) ho tsoa ho bakuli kankere ea colon ntle le kalafo ea span'cy. E ipapisitse le ts'ebetso eohle e phethahetseng (wes), Rna-seq ea data, tlhaiso-leseling ea makhopho e tsoang ho bakuli ba ka tlase ho lilemo tse 34. Sehlopha sa lipatlisiso se bitsoang sesebelisoa sena sa Sidra-lumc ac: 'mapa le tataiso ea koetliso ea mofetše-microbiome (Setšoantšo sa 1).

Classication ea limolek'hule e sebelisang ICR

Ho hapa karolo ea matšoao a ho itšireletsa ea lefu la tsoekere bakeng sa ho itšireletsa ka mofets'e, ho kenyeletsa le melangoana e fapaneng ea mofuta o fapaneng ea mofuta oa 1, ho kenyelletsa le mofetše oa mofetše, le mofetše oa matsoele. ICR e boetse e amahanngoa le karabelo ea ho ikoetlisa ka mefuta e fapaneng ea mofets'e, ho kenyeletsa kankere ea matsoele.

Taba ea pele, bafuputsi ba netefalitse setloholo sa ICR sa Cohort ea AC-ICR tumors) (Setšoantšo sa 1b). Bafuputsi ba ne ba khetholla boikaketsi ba 'mele bo amanang le Constansus monko, sehlopha sa ho ngolla sengoliloeng sa Coloen. Mekhahlelo ea CMS e ne e kenyelletsa CMS1 / Ho itšireletsa, CMS2 / Metabolic le CMS4 / MES4 / MENENCYAL. Tlhahlobo e bontšitse hore lintlha tse ling tsa ICR li ne li kopanetsoe ka mekhoa e meng ea mofets'e ho li-sumtypes tse ntle tsa CMS.

Li-CMS tsohle, bongata ba killer ea tlhaho (nk) li-subsets tse phahameng haholo tsa Icy Ho ICR ho tloha tlase ho phahameng (Setšoantšo sa 1D), ho netefatsa karolo ea borucha ka mofekotsi oa carlical.

Setšoantšo sa 1. Morero oa ho ithuta oa thuto ea AC-ICAM, signature e amanang le ho itšireletse ea ho itšireletse ea ho itšireletse
ICR e ts'oaretsoe
Ke lisele tsa T tsa T-tsa TUMR tse tlalehiloeng ho tsekisano bakeng sa li-antigens tsa tumor (ka tlase ho 10%). Ka hona, boholo ba lisele tsa Instra-tumor li bitsoa lisele tsa Tumter tsa Tum (ka mor'a moo lisele). Khokahano e matla ka ho fetisisa e nang le palo ea lisele tse tloaelehileng tsa TC e nang le li-tCR tsa li-tCR tsa STRIL Li-clust tsa ICR (ka kakaretso le CMS ea CMS), Mollo o Phahameng oa PMS1 / CMS Subtype CMS1 / CMS. U sebelisa mofuta o felletseng oa mofuta ona (18,270 - mefuta ea dino tsa lefutso (Isng, CXCL10 Boikemisetso ba ho ikoetlisa bo hlophisitsoe ka matla ka liphatsa tsa lefutso tse ngata ho feta li-cortations tse amanang le li-cd8 +. Qetellong, ho hlahlojoa ka holimo ho fana ka maikutlo a hore letšoao la ICR le hapa ho ba teng ha tumor, le amplited tlileng le lisele tsa Tsheno ebile li ka hlalosa moelelo oa eona oa ho hlaha.

Setšoantšo sa 2. TRCCR Metric le Khokahano ea Temo e nang le Marang-rang e sa Hloekiloeng ke ho itšireletse
Microbiome sebopeho ho lisele tse phetseng hantle le tsa Colon kankere ea kankere
Bafuputsi ba entse RRNA ea 16s RRNA e sebelisoang DNA e hlalositsoeng e tsoa tumor le bo-raliphelo ba kolone e tsoang bakuli ba 246 (Setšoantšo sa 3A). Bakeng sa netefatso, bafuputsi ka mokhoa o hlakileng o ile oa hlahloba lintlha tsa ho supa data ho tsoa ho tsamonami tse ling tse 42 tse neng li se na DNA tse tloaelehileng tse neng li fumaneha bakeng sa ho hlahlobisisa. Taba ea pele, bafuputsi ba ile ba bapisa le masimo a mang a mang pakeng tsa li-tumors tsa li-tumors le lisele tsa kolone. Maservarium ha a eketsehe haholo ka mathuleng a bapisoang le li-sampole tse phetseng hantle (Setšoantšo sa 3a-3D). Ho ne ho se na phapang ea bohlokoa ka har'a alland (phapang e ngata ea sempole e le 'ngoe) pakeng tsa tumor le li-tumors tse phahameng.
Ho bona litloaelo tse amehang tsa bongaka pakeng tsa liphatsa tsa likotoana le sephetho sa bana, bafuputsi ba ikemiselitse ho sebelisa lintlha tse 16 tsa lefutso ho pholoha pholoha ho pholoha. Ha a le AC-ICOM246, bafuputsi ba ne ba khetha mofuta oa likhomo tsa OSS
Ka koetliso ena ea thupelo (ICAM246), e tlase ea MBR e tlase (MBR <0, tlase MBR) e ne e amahanngoa le kotsi e tlase ea lefu (85%). Bafuputsi ba netefalitse botsoalle pakeng tsa MBR e tlase (Kotsi) le Os e bolelele ba li-cohort tse peli tse netefalitsoeng (ICGA-Coad). .

Setšoantšo sa 3. Microbiome ka hlasimo le likamano tsa bophelo bo botle le kamano le ho pholoha ha mokuli.
Sephetho
Mokhoa o mengata oa batho ba bangata o sebelisitsoeng thutong ena o thusa ho khesoa ka mokhoa oa ho itšireletsa mafung oa karabelo ea botona le botšehali le ho bona tšebelisano lipakeng tsa microbioome le tsamaiso ea 'mele. Ho leka-hare ho Timor Titquenction ea hlahala le lisele tse phetseng hantle li ile tsa senola hore mokhoa oa khale o entsoe ka lebaka la bokhoni ba eona ba ho hapa maikutlo.

Ka ho sekaseka sebopeho sa konoko ho sebelisa mofuta oa li-microbiome tse 16 RRNA ea lefu la AC-ICOM Leha signe e ne e tsoa ho li-sampole tse tsoang ho hlama, ho bile le kamano e matla lipakeng tsa coloctum ea kalafo le tumor mbb, e fana ka tlhahiso ea hore ho saena hona ho ka nka sebopeho sena sa bakuli. Ka ho kopanya likolo tse ngata tsa ICR le MBR, li ne li ka khona ho tseba le ho netefatsa bioparker ea seithuti se fapaneng tse bolelang hore bakuli ba nkile mafefo a bokhukhu. Papali ea pele ea thuto ea OMM e fana ka sesebelisoa ho utloisisa hantle mofets'e o motle oa ho utloisisa lefu la concon le thusa ho fumana mekhoa ea kalafo.

Resort:
Roelands, J., Kuppen, PJK, Ahmed, Ei et al. Bohlahla bo kopaneng, ba nang le maqhubu a likokoana-hloko le atlas ea kankere ea coloon. Natu 29, 1273-1286 (2023).